原標題:熱科院全球首次完成并公布椰子全基因組測序
多國研究單位希望深度合作
海口網11月2日消息(記者龍易強?通訊員鄔慧彧)近日,記者從中國熱帶農業科學院了解到,由熱科院椰子研究所、熱帶生物技術研究所、華大基因和法國農業國際合作研究中心(CIRAD)等單位共同完成了椰子(Cocos?nucifera?L)的基因組測序拼接及序列分析工作,海南高種椰子全基因組測序的完成及公布尚屬全球首次。
據了解,該項研究是在省科技廳國際合作專項、科技重大專項和熱科院基本業務費的支持下,由熱科院椰子研究所主導完成,并于10月5日在線發表在《大數據科學》(GigaScience)雜志上。該研究完成了對椰子的基因組序列拼接,生成了大小為2.20Gb的椰子基因組草圖,基因組覆蓋度90.91%(2.42Gb)。作為椰子的藍圖,整個基因組存在28039蛋白質編碼基因,歸屬于14411個基因家族,其中有282個家族是椰子特有的,這些信息為椰子功能基因組的研究提供了很好的基礎。目前圍繞基因組序列數據基礎,一個高密度的遺傳圖譜及更精細的椰子基因組圖譜正在構建中,棕櫚染色體的演化及椰子耐鹽的特性的組學分析工作也將于近期完成。
椰子全基因組公布的同時也開啟了椰子的后基因組時代,海南高種椰子作為一個參考基因組,將為椰子個體的重測序、功能基因的挖掘(高抗,優質相關)及抗逆分子機理(低溫、高鹽、干旱等)和重要品種形成機理的研究(香味、顏色等)、DNA分子標記的開發、椰子重要農藝性狀的解析和關聯分析、全基因組關聯分析等提供參考體系,同時也為國內外椰子科技的合作提供紐帶,抗寒、耐旱、耐鹽、高油基因組的挖掘與利用有可能推動椰子產業取得飛躍性進展。
“這是椰子所占據全球椰子研究制高點的關鍵一步,是全球椰子科技里程碑性的事件,對于擴大中國在全球的科技影響意義巨大,同時將極大地促進椰子遺傳育種的研究與應用。”熱科院一位專家介紹道,目前該信息已經引起椰子科技界的轟動,法國、澳大利亞、斯里蘭卡、印度等國家的研究單位已向熱科院提出進一步深度合作的希望。
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